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馬克西瑪公主兒童腫瘤中心Ruben van Boxtel、Hubrecht研究所 Hans Clevers 等人在 Cancer Cell 期刊發(fā)表了題為：Improved detection of colibactin-induced mutations by genotoxic E. coli in organoids and colorectal cancer 的研究論文。該研究揭示了基因毒性大腸桿菌在類器官和結(jié)直腸癌中誘導(dǎo)的基因突變。
大腸桿菌攜帶的聚酮合酶(pks)操縱子與結(jié)直腸癌(CRC)風(fēng)險(xiǎn)增加有關(guān)，該操縱子負(fù)責(zé)產(chǎn)生基因毒素colibactin，pks+大腸桿菌菌株在細(xì)胞系中會(huì)誘導(dǎo)DNA雙鏈斷裂(DSB)，進(jìn)一步分析顯示，colibactin是結(jié)直腸癌基因組突變的一個(gè)來源。>>>商務(wù)洽談，點(diǎn)此處，在線咨詢
大腸桿菌Nissle 1917菌株(EcN)是一種研究較多的益生菌株，通常用于治療炎癥性腸病(IBD)。值得注意的是，EcN菌株同樣也攜帶pks操縱子。之前的研究表明，與其他pks+菌株相比，EcN引起DNA雙鏈斷裂(DSB)的能力降低。此外，最近的一些研究也表明，EcN在CHO細(xì)胞(中國倉鼠卵巢細(xì)胞)中具有DNA誘變作用。
然而，迄今為止沒有證據(jù)表明在原代人類細(xì)胞中存在全基因組范圍內(nèi)的EcN誘導(dǎo)突變，其與其他pks+大腸桿菌菌株的相對(duì)誘變性尚不清楚。
為了解決這個(gè)問題，研究團(tuán)隊(duì)使用之前建立的人類類器官共培養(yǎng)系統(tǒng)和全基因組測(cè)序確定了一系列pks+大腸桿菌菌株的突變后果，包括EcN和3個(gè)結(jié)直腸癌來源的大腸桿菌菌株。該研究開發(fā)了2種計(jì)算方法——1)依靠colibactin DNA目標(biāo)基序、2)隨機(jī)森林模型，以提高對(duì)單個(gè)colibactin誘導(dǎo)突變的檢測(cè)。
結(jié)果顯示，該研究中的所有大腸桿菌菌株，包括EcN，都表現(xiàn)出不同程度的致突變活性。此外，將個(gè)體突變歸因于colibactin的機(jī)器學(xué)習(xí)方法揭示了colibactin誘導(dǎo)的突變患者在較年輕的年齡被診斷，并且colibactin可以誘導(dǎo)特定的APC突變。這些方法在約12%的結(jié)直腸癌基因組甚至整個(gè)外顯子組測(cè)序數(shù)據(jù)中檢測(cè)到colibactin誘導(dǎo)的突變，這是確定不同pks+大腸桿菌菌株的致突變活性的關(guān)鍵一步。
來源：生物世界
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【項(xiàng)目地點(diǎn)】：江蘇 南通
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【項(xiàng)目成果】：南通瑞翔新材料有限公司(以下簡稱：瑞翔新材)是專業(yè)從事新能源材料研發(fā)、制造、銷售的高新技術(shù)企業(yè)，注冊(cè)資本4.678億元，聚焦于鋰離子電池正極材料的研發(fā)與生產(chǎn)，是知名的專業(yè)正極材料供應(yīng)商，也是世界500強(qiáng)企業(yè)甘肅金川集團(tuán)下屬控股公司。公司主要產(chǎn)品為三元材料、錳酸鋰、磷酸鐵鋰、磷酸錳鐵鋰及鈉電等正極材料，廣泛應(yīng)用于動(dòng)力電池、儲(chǔ)能電池、消費(fèi)電池三大領(lǐng)域。瑞翔新材構(gòu)建了多元化產(chǎn)品矩陣，在高功率、高電壓動(dòng)力電池正極材料制造方面建立了優(yōu)勢(shì)，是國際知名主流車企供貨商之一。
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【項(xiàng)目成果】：申啟生物IVD生物檢測(cè)實(shí)驗(yàn)/潔凈室工程由CEIDI西遞公司提供EPC總包服務(wù)。西遞公司是上海的一家高新技術(shù)企業(yè)，擁有設(shè)計(jì)乙級(jí)資質(zhì)、施工建筑總承包二級(jí)資質(zhì)、裝飾裝修二級(jí)資質(zhì)、機(jī)電安裝二級(jí)資質(zhì)、環(huán)保及鋼結(jié)構(gòu)二級(jí)資質(zhì)、防水防腐保溫工程二級(jí)資質(zhì)，CEIDI西遞專業(yè)水平贏得客戶好評(píng)，歡迎咨詢：400-666-1693
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